www.biotechugamg.fora.pl

aga_b

Nasze dzisiejsze pytania:
1. Co to jest m.o.i
2. Co jest kluczowym elementem lizy/lizogenii?
3. Zadanie na m.o.i (Hania chyba spisala:))
4. Opisac geny wczesne
5. Mechanizm retroregulacji
6. Molekularny mechanizmrepresji i autoregulacji CI.

Cwiczenia troche zakrecone- poczatkowo w ogole nie kumalam o co ten facet walczy, ale jakos poszlo:P W pewnym momencie wszyscy cos robili a trzeba bylo juz cos wyciagac;D A my bylysmy w 5;D Prowadzacy nawet spoko. A skonczylismy o 15.45.

Wejsciowek nie sprawdzil od razu wiec nikt nie wylecial:D

jaskolczegniazdo

dziękujemy Mateusz!!
naprawde kawał porzadnej roboty Smile

Ailin

co bierzemy pod uwage przy projektowaniu wektora fagowego:

-wielkość wprowadzanego DNA <DNA faga powyżej 102% nie chodzi do główki, za małe też nie>
-jakich używamy enzymów restrykcyjnych <by nie uszkodzić genów niezbędnych>
- czy wektor ma służyć do ekspresji wklonowanego DNA
- czy obce DNA ma być późnej z wektora ponownie pobrane <przetłumaczcie sobie "be rescued from the vector>
- "whether the foreign DNA carried in the vector is to be assembled into a large overlapping contig of cloned DNAs" Shocked

źródło - Sambrook <zaraz po tym fragmencie który dał nam facet na stronie XD >

HaNiA

Ailin

Mateusz

Wejściówka grupy 3:
1. Co się stanie, gdy do komórki lizogennej wniknie kolejny fag, Wyjaśnij ten proces.
2. Co należy wziąć pod uwagę przy projektowaniu wektora fagowego?
3. Zadanie na m.o.i., podobne do tego, które miała grupa 1
4. Co się stanie, jeśli w środowisku, w którym jest komórka jest mało glukozy (to pytanie było testowe).
5. Wyjaśnij terminy plon fagowy i intasom.

Jakub

Czy było jakoś szczególnie potrzebne przeczytanie tej publikacji po angielsku o fagu lambda na pierwsze ćwiczenia. Czy wiadomości w skrypcie nie są po prostu ekstraktem m.in. z tej publikacji? Nie chce mi się przedzierać się przez nią, by potem stwierdzić, że nic nowego się nie dowiedziałem.... :/

Natalia

tzn zalezy jakie pytanie dostaniesz Wink

gr wtorkowa z tego co pamietam mówiła, ze w publikacji sa najważniejsze rzeczy. Przede wszystkim jest bardziej szczegołowa - bardziej wyjasnione pewne mechanizmy regulacji itp.

Skrypt to ogólniki, publikacja to zagłebienie się w temat.

n3l

Kubo, moja rada to skup sie na publikacji po ang Smile

maxi king :)

Ja uczyłam się tylko ze skryptu, tej publikacji po ang nawet nie tknęłam(bardziej z braku czasu niż lenistwa), ale przyznam, że te kilka stron skryptu wykułam jak bum cyk cyk. Jak kto woli...

jarek

Wejściówka grupy 4:
1. Pojęcia: łysinka, replikacja theta - oczywiste
2.Jaki będzie efekt mutacji genów i dlaczego:
-hflb - promowanie lizogenii (wzrost stężenia CII itd.)
-P i O - wydaje mi się, że powstaną puste główki i ogonki
3.W jakich formach DNA faga może występować?
-konkatamery
-liniowa
-kolista
4.Oblicz m.o.i po dodaniu 10ul 5*10^9 pfu/ml roztworu fagowego do 10ml bakterii o OD=0,2
5.Co oznacza indukcja profaga i jakie czynniki mogą ją wywołać?
-UV
-wzrost temperatury
-wzrost stężenia substancji odżywczych w podłożu
-podział komórki (chwilowy spadek stężenia CI)

Natalia

a ma ktos giełdy na ćw 2? ;D

Justyna

MUTAGENEZA TRANSPOZONOWA
Gr.1
1. roznica miedzy pMarB i pMarC
2. transdukcja ogólna a specyficzna
3. efekty wbudowania transpozonu
4. co to hot spot
Gr.2
1. roznica miedzy pMarA i pMarB i mozliwosci z tego plynace
2. Zalety transdukcji
3. mechanizm transpozycji cut & paste
4.Mechanizm oporności na kanamycyne.
Gr.3
1.co to jest: DDE, cząstka transdukująca, kompetencja.
2.Mechanizm cut&paste.
3.Roznica pomiedzy transpozonem a IS
Gr.4
1.opisać ruchomy element w plazmidzie z ćwiczeń
2.coś o różnicach w rekombinacji miejscowo specyficznej i ogólnej
3.jaki typ transdukcji przeprowadzają fagi lambda, P1 i jeszcze jakiś
4.co to jest transdukcja poronna i co to jest HGT

grzesiek

jako ze warto zbierac pytania bo na zboja sie przydaja to podaje pyt z naszej grupy
1. wyjasnic terminy:
-replikacja sigma
-centrum infekcyjne
2. co to antyterminacja, do czego jej fag uzywa i ich przyklady
3. czemu mutujemy geny kapsydu
4. wyjasnij proces opuszczania kom bakteryjnej przez czasteczke faga
5. co i dlaczego powoduja mutacje w genach
-IHF
-J